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micromol:metab_microb

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micromol:metab_microb [2017/05/04 14:28]
admin
micromol:metab_microb [2023/11/21 12:43] (actual)
admin_ext [Integrantes]
Línea 1: Línea 1:
 ===== Identificación de productos microbianos de interés agroindustrial ===== ===== Identificación de productos microbianos de interés agroindustrial =====
  
-Se trabaja en la evaluación del potencial de producción ​de compuestos ​bioactivos y/o enzimas ​de interés ​agroindustrial a partir de una colección de más de 300 cepas de //​Streptomyces ​spp.// aisladas en Uruguay, la cual fue generada ​a partir de estudios ​previos ​realizados por nuestro ​grupo. ​Para ello, se propone la integración ​de dos enfoques novedosos y complementarios:​ la metabolómica ​la bioinformática. Se aplicarán técnicas ​de minería genómica ​para la identificación de clusters genéticos ​involucrados en la biosíntesis de compuestos bioactivos y/enzimasde interés ​en los genomas ​de cepas de //​Streptomyces// ​secuenciadas por nuestro grupoPor otro lado, se determinará el perfil metabolómico madiante espectroscopía de resonancia magnética nuclear ​(RMNen la colección ​de cepas de //​Streptomyces// ​y se evaluarán diferentes actividades ​de potencial aplicación agroindustrialEn esta línea se trabaja en colaboración con el DrGuillermo ​Moyna del Departamento de Química del Litoral del Centro Universitario Regional Norteel DrJosé Hughet-Tapia ​de la Universidad de FloridaEstados Unidos.+==== Resumen ==== 
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 +{{ :​micromol:​foto_linea_metabolitos_microbianos_1_.jpg?​350|}} 
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 +Esta nueva línea de investigación está enfocada a la búsqueda ​de compuestos ​con de potencial aplicación ​agroindustrial a partir de una colección de cepas de //​Streptomyces// ​spp. generada ​en trabajos ​previos ​del grupo. ​Dado el reconocido potencial de producción de compuestos bioactivos que presenta este género, se considera relevante desarrollar estudios en esta temática con el objetivo ​de valorizar los recursos microbianos disponibles. Actualmente se están realizando diferentes screenings de actividad antimicrobiana,​ nematicida ​de promoción del crecimiento vegetal, con el objetivo de seleccionar las cepas con mayor potencial. También se están aplicando abordajes metabolómicos para analizar los perfiles metabólicos de las cepas. Se complementa este trabajo con la implementación ​de análisis genómicos ​para la identificación de los clusters genéticos ​responsables de la biosíntesis de los compuestos bioactivos ​identificados. Esta propuesta de investigación tiene proyección a potenciales aplicaciones en el área agroindustrial de creciente desarrollo en nuestro país. 
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 +==== Integrantes ==== 
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 +=== Estudiantes === 
 +  * **Lic. Sofía Zeballos** Estudiante de Maestría en Bioinformática. 
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 +=== Investigadores asociados === 
 +  * **Dr. Guillermo Moyna.** Prof. Titular Departamento de Química del Litoral, CENUR Litoral Norte. 
 +  * **Dr. Gustavo Salinas.** Prof. Agregado del Laboratorio de Biología de Gusanos, Unidad mixta de la Facultad de Química Udelar ​del Institut Pasteur de Montevideo. 
 +  * **Dr. Ryan F. Seipke.** Associate Professor, University of Leeds, UK. 
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 +==== Proyectos de investigación recientes ​o en ejecución ==== 
 +  * **2019-2021. Búsqueda de actividades de interés agrícola a partir ​de cepas de //​Streptomyces// ​sppaisladas en Uruguay.** Proyecto ANII-FCE ​(Modalidad II). Responsable:​ MSc. V. Croce. 
 +  * **2017-2019. Integración de la minería genómica y la metabolómica para descifrar el potencial ​de metabolitos bioactivos en cepas de //​Streptomyces//​ de Uruguay.** Proyecto CSIC I+DResponsable:​ M.J. Pianzzola. 
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 +==== Publicaciones ==== 
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 +|Croce V., López-Radcenco A., Lapaz M.I., Pianzzola M.J., Moyna G.Siri M.I. (2021) **An integrative approach for the characterization of plant-pathogenic //​Streptomyces//​ spp. strains based on metabolomic,​ bioactivity,​ and phylogenetic analysis. ** //Frontiers in Microbiology // [[https://​www.frontiersin.org/​articles/​10.3389/​fmicb.2021.643792/​full|{{:​boton_pdf.png?​30|Ver ​el artículo}}]] | 
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 +|Lapaz M.I., López A., Huguet-Tapia ​J.C.Pérez-Baldassari M.P., Iglesias C., Loria R., Moyna G.,  Pianzzola M.J. (2018) ​ **Isolation and structural characterization of a non-diketopiperazine phytotoxin from a potato pathogenic //​Streptomyces//​ strain. ** //Natural Product Research // [[https://​www.tandfonline.com/​doi/​full/​10.1080/​14786419.2018.1511554|{{:​boton_pdf.png?​30|Ver el artículo}}]] | 
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micromol/metab_microb.1493918910.txt.gz · Última modificación: 2017/05/04 14:28 por admin