micromol:fitopatogenos [Cátedra de Microbiología]

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===== Estudio de bacterias fitopatógenas =====

==== Resúmen ====

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Se apunta a caracterizar poblaciones de bacterias patógenas de importancia agrícola, abarcando el estudio de enfermedades que afectan a los cultivos de papa, tomate, cebolla y trigo. Los trabajos realizados han permitido generar conocimiento sobre el tipo de cepas patógenas presentes en nuestro país, información esencial para luego definir estrategias de manejo eficaces. También se trabaja en diferentes aspectos incluyendo el desarrollo de variedades resistentes asistiendo a los programas de mejoramiento genético, desarrollo de métodos moleculares de diagnóstico, tipificación molecular de las poblaciones de patógeno presentes en el país, y aspectos básicos como el estudio de los mecanismos de defensa vegetal y de los determinantes genéticos involucrados en la patogenicidad. Estos estudios implican el uso de diferentes metodologías incluyendo técnicas microbiológicas, moleculares y ensayos con plantas. Más recientemente también estamos incorporando abordajes masivos para el estudio de estas interacciones planta-patógeno, incluyendo análisis genómicos, transcriptómicos y metabolómicos. Se realiza un trabajo multidisciplinario en conjunto con investigadores de otras instituciones (Facultad de Agronomía, INIA, MGAP, INASE).

==== Integrantes ====

=== Estudiantes ===

  * **Lic. Felipe Clavijo.** Estudiante de Doctorado en Biotecnología
  * **Lic. Stefanie De Armas.** Estudiante de Maestría en Ciencias Biológicas (PEDECIBA)
  * **Lic. Sofía Fort.** Estudiante de Maestría en Biotecnología
  * **Bach. Nicol Denis.** Estudiante de Licenciatura en Química
  * **Bach. Florencia Alcoba.** Estudiante de Licenciatura en Bioquímica
  * **Bach. Valentina Stancov.** Estudiante de Licenciatura en Bioquímica

=== Investigadores asociados ===

  * **Dr. Guillermo Galván.** Prof. Titular del Departamento de Producción Vegetal, Centro Regional Sur (CRS), Facultad de Agronomía, Universidad de la República.
  * **Dra. Paola Gaiero.** Prof. Adjunto del Departamento de Biología Vegetal, Facultad de Agronomía, Universidad de la República.
  * **Dr. Francisco Vilaró.** Prof. Libre del Departamento de Biología Vegetal, Facultad de Agronomía, Universidad de la República.
  * **Dr. Matías González Arcos.** Investigador Adjunto INIA Salto Grande
  * **Dra. Silvia Pereyra.** Investigadora Principal Referente INIA La Estanzuela
  * **Dr. Marco Dalla Rizza.** Coordinador de la Unidad de Biotecnología e Investigador Principal INIA Las Brujas 
  * **Dr. Esteban Vicente.** Investigador Principal INIA Salto Grande

==== Proyectos de investigación recientes o en ejecución ====

  * **2019-2023. Bacterias fitopatógenas: mecanismos de resistencia hospedera y de interacción planta patógeno.** Programa CSIC Grupos I+D. Responsables: Dra. M.I. Siri y Dr. G. Galván.
  * **2018-2021. Herramientas para el diagnóstico, estudio y manejo de la estría bacteriana de trigo causada por //Xanthomonas translucens//.** Proyecto ANII-FCE. Responsable: M.I. Siri
  * **2018-2021. Efecto del receptor AtEFR en germoplasma avanzado de papa para la resistencia a la marchitez bacteriana.** Proyecto ANII-FMV. Responsable: Dr. Marco Dalla Rizza. 

==== Publicaciones (últimos 5 años) ====

| Croce V., López-Radcenco A., Lapaz M.I., Pianzzola M.J., Moyna G., Siri M.I. (2021) **An integrative aproach for the characterization of plant-pathogenic //Streptomyces// spp. strains based on metabolomic, bioactivity and phylogenetic analysis** //Frontiers in Microbiology// [[https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.643792|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |

| Stice S.P., Shin G.Y., De Armas S., Koirala S., Galván G.A., Siri M.I., Severns P.M., Coutinho T., Dutta B., Kvitko B.H. (2021) **The distribution of onion virulence gene clusters among //Pantoea// spp.** //Frontiers in Plant Science// [[https://doi.org/10.3389/fpls.2021.643787|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |

| Fort S, Ferreira MV, Murchio S, Schvartzman C, Galván GA, Vilaro F, Siri MI, Dalla Rizza M. (2020) **Potato plants transformed with the //Arabidopsis// EF-Tu receptor (EFR) show restricted pathogen colonization and enhanced bacterial wilt resistance under conditions resembling natural field infections.** //Agrociencia Uruguay// [[http://agrocienciauruguay.uy/ojs/index.php/agrociencia/article/view/413|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |

| FAnsari M., Taghavi S.M., Hamzehzarghani H., Valenzuela M., Siri M.I., Osdagui E. (2019) **Multiple introductions of the tomato pathogen //Clavibacter michiganensis// subsp. //michiganensis// into Iran as revealed by a global-scale phylogeographic analysis.** //Applied and Environmental Microbiology.// [[https://aem.asm.org/content/85/24/e02098-19|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Lapaz M.I., Cisneros Juarez E., Pianzzola M.J., Francis I.M. (2019) **Exploring the exceptional properties of //Streptomyces//: a hands-on discovery of natural products.** //The American Biology Teacher// [[https://online.ucpress.edu/abt/article/81/9/658/109768/Exploring-the-Exceptional-Properties-of|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Rodríguez M.V., Tano J., Anzaldi N., Carrau A., Srebot M.S., Ferreira V., Martínez M.L., Cortadi A.A., Siri M.I., Orellano E.G. (2019) **Anatomical and biochemical changes induced by //Gluconacetobacter diazotrophicus// stand up for //Arabidopsis thaliana// seedlings from //Ralstonia solanacearum// infection.** //Frontiers in Plant Sciences.// [[https://doi.org/10.3389/fpls.2019.01618|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Lapaz M.I., López A., Huguet-Tapia J.C., Pérez-Baldassari M.P., Iglesias C., Loria R., Moyna G.,  Pianzzola M.J. (2018) **Isolation and structural characterization of a non-diketopiperazine phytotoxin from a potato pathogenic Streptomyces strain.** //Natural Product Research// [[ https://doi.org/10.1080/14786419.2018.1511554|{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Ferreira V., Pianzzola M.J., Vilaró F., Galván G.A., Tondo M.L., Rodriguez M.V., Orellano E.G., Valls M., Siri M.I. (2017) **Interspecific potato breeding lines display differential colonization patterns and induced defense responses after //Ralstonia solanacearum// infection.** //Frontiers in Plant Sciences// [[https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01424 |{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Boschi F., Schvartzman C., Murchio S., Ferreira V., Siri M.I., Galván G.A., Smoker M., Stransfeld L., Zipfel C., Vilaró F.L., Dalla-Rizza M. (2017) **Genotypic and phenotypic characterization of //Streptomyces// species causing potato common scab in Uruguay** //Frontiers in Plant Sciences// [[https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01642 |{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Lapaz M.I., Huguet-Tapia J.C., Siri M.I., Verdier E., Loria R., and Pianzzola M.J. (2017) **Enhanced bacterial wilt resistance in potato through expression of //Arabidopsis// EFR and introgression of quantitative resistance from //Solanum commersonii//** //Phytopathology// [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-16-1348-RE
 |{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Croce V., Pianzzola M.J., Durand K., González-Arcos M., Jacques M.-A., Siri M.I. (2016) **Multilocus Sequence Typing reveals high variability among //Clavibacter michiganensis// subsp. //michiganensis// strains affecting tomato crops in Uruguay** //European Journal of Plant Pathology// [[https://link.springer.com/article/10.1007/s10658-015-0738-0 |{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |


| Guarischi-Sousa R., Puigvert M., Coll N.S., Siri M.I., Pianzzola M.J., Valls M., and Setubal J.C. (2016) **Complete genome sequence of the potato pathogen //Ralstonia solanacearum// UY031.** //Standards in Genomic Sciences// [[https://environmentalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40793-016-0131-4 |{{:boton_pdf.png?30|Ver el artículo}}]] |
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